1、使用范围不同。普通发票使用范围较广。而增值税专用发票只限于增值税一般纳税人使用，使用范围窄。

2、作用上的不同。普通发票只是一种收付款凭证，而增值税专用发票既是财务收支的凭证，又是兼记销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明，是购货方据以抵扣税款的主要依据。

3、开具内容不同。普通发票内容只填写交易的数量、价格。而增值税专用发票既填写交易数量、价格，也填写纳税人税务登记号、开户银行及账号、地址、电话号码和税款。

4、价格特征的不同。普通发票反映的是含税价。而增值税专用发票反映的价格是不含税价等内容。

5、抵扣条件不同。增值税专用发票不仅是购销双方收付款的凭证，而且是增值税一般纳税人购买方的抵扣凭证。而增值税普通发票除税法规定的经营项目外都不能抵扣。

专用发票一般是增值税一般纳税人使用的，一般情况下，不包括小规模纳税人，小规模纳税人只能经税务机关批准后由当地税务机关代开；普通发票是未办理税务登记的纳税人也可直接向税务机关申请领购使用。

发票的印制要求不同，增值税专用发票由国务院税务主管部门指定的企业印制；其他发票，由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。