京东小金存不能全部赎回的原因主要有以下三种：

1、部分基金赎回具有保底要求，需要按照一定的规则去操作才能全部赎回，如双周赎回一次、双月赎回一次、单赎回一次等到，按照基金的赎回规则去操作就能全部赎回该基金。

2、小金存出现了亏损，所以会损失一部分本金。

3、赎回时显示的是份额，而非金额，所以份额会比金额数值少，但是到账后钱是一样多的。