多个支付宝花呗额度是独立的，花呗多个账户开通的情况下，账户是分开管理的。即账户之间独立消费、分开还款。另外，支付宝规定，一个身份证下的多个支付宝账户，只允许一个支付宝账户签约消费信贷产品，包括花呗。